Le monde d'El Kardian est le continent appelé Aldania, qui a la forme d'un embryon. Le jeu se déroule 10 ans après la chute d'un grand empire appelé Roran Nordria. El Kardian est maintenant prèt à commencer sa journée.
L'histoire principale se construira au fil du jeu en fonction des actions conjuguées des joueurs et des animateurs.